Совет института является основным органом самоуправления, который создается с целью решения основных вопросов деятельности института.
Совет МГЭИ им. А.Д. Сахарова БГУ в следующем составе (Приказ от 27.11.2017 № 369-0 “О составе Совета института”):
- Маскевич Сергей Александрович, директор – Председатель Совета
- Позняк Сергей Степанович, заместитель директора по научной работе
- Бученков Игорь Эдуардович, заместитель директора по учебной и воспитательной работе
- Батян Анатолий Николаевич, заведующий кафедрой экологической медицины и радиобиологии
- Бондарук Роман Сергеевич, магистрант факультета экологической медицины
- Бояркин Олег Михайлович, профессор кафедры общей и медицинской физики
- Бусько Евгений Григорьевич, профессор кафедры экологической медицины и радиобиологии
- Герменчук Мария Григорьевна, заведующий отделом радиационной безопасности государственного научно-технического учреждения «Центр по ядерной и радиационной безопасности» Министерства по чрезвычайным ситуациям Республики Беларусь (по согласованию)
- Головатый Сергей Ефимович, заведующий кафедрой экологического мониторинга и менеджмента
- Гончарова Надежда Вячеславовна, заведующий кафедрой ЮНЕСКО
- Довгулевич Наталья Николаевна, заведующий кафедрой лингвистических дисциплин и межкультурных коммуникаций
- Довгучиц Жанна Юрьевна, председатель профсоюзного бюро работников
- Жинко Юлия Владимировна, студент 3 курса факультета мониторинга окружающей среды
- Журавков Владислав Владимирович, декан факультета мониторинга окружающей среды
- Зафранская Марина Михайловна, заведующий кафедрой иммунологии и экологической эпидемиологии
- Иванюкович Владимир Александрович, заведующий кафедрой экологических информационных систем
- Киевицкая Анна Ивановна, заведующий кафедрой ядерной и радиационной безопасности
- Конопелько Ольга Михайловна, председатель студенческого научного общества
- Кошкина Наталья Евгеньевна, начальник отдела воспитательной работы с молодежью
- Круталевич Михаил Михайлович, заведующий кафедрой физического воспитания
- Лысухо Наталья Александровна, начальник НИС – секретарь Совета
- Лях Юрий Григорьевич, профессор кафедры общей экологии, биологии и экологической генетики
- Малишевский Виктор Феликсович, заведующий кафедрой общей и медицинской физики
- Миронова Джессика Александровна, студент 3 курса факультета экологической медицины, староста
- Новикова Наталья Михайловна, начальник учебно-методического отдела
- Пасечник Илья Дмитриевич, студент 3 курса факультета мониторинга окружающей среды
- Пашинский Василий Антонович, заведующий кафедрой энергоэффективных технологий
- Пашкевич Василий Александрович, студент 4 курса факультета мониторинга окружающей среды, председатель первичной профсоюзной организации студентов
- Пекарт Артем Александрович, студент 4 курса факультета мониторинга окружающей среды, заместитель секретаря БРСМ
- Плавинский Николай Александрович, заведующий кафедрой социально-гуманитарных наук и устойчивого развития
- Порада Наталия Евгеньевна, доцент кафедры иммунологии и экологической эпидемиологии
- Прищепа Иосиф Алексеевич, заведующий аспирантурой
- Путик Владимир Станиславович, декан факультета повышения квалификации и переподготовки
- Смолякова Раиса Михайловна, заведующий кафедрой общей экологии, биологии и экологической генетики
- Снытков Евгений Владимирович, аспирант факультета экологической медицины
- Сыса Алексей Григорьевич, заведующий кафедрой экологической химии и биохимии
- Тимощенко Андрей Игоревич, заведующий кафедрой ядерной физики БГУ (по согласованию)
- Шунько Андрей Дмитриевич, студент 4 курса факультета мониторинга окружающей среды
- Ясайте Мария Петровна, магистрант факультета экологической медицины
- Ясовеев Марат Гумерович, декан факультета экологической медицины